可能需要修改企业所得税申报表有以下几种情况：

1. 高估利润导致了高估所得税负债，在这种情况下，应在修订的申报表中要求退还多缴的所得税。
2. 低估利润导致了低估所得税负债，在这种情况下，纳税人除了要补缴少缴纳的所得税，还可能面临罚款和利息的潜在风险。
3. 利用净经营亏损（NOL）结转，或者外国税收抵免等等方式申请所得税退税

要提交修订的所得税申报表，必须遵守提交修订所得税申报表的时间限制。尤其需要注意的是在涉及退税申请的情况下，法规或条例可能会指定一个不同的日期作为申报日期或付款日期。

1. 法定评估的时限
   
   （1） 按照标准惯例，国税局规定了从提交纳税申报表之日起或从支付税款之日起计算的三年期限，在此期限内，他们可以评估和征收任何额外的所得税。
   
   （2） 对总收入的严重漏报（超过 25%）有为期六年的评估。
   
   （3） 对欺诈性申报，没有评估的时间限制。
   
   
2. 提交修订的所得税申报表的时限
   
   根据《美国税收法规》(IRC)，允许个人提交修订的所得税申报表的时限通常为三年。IRC 还规定了退税申请的时限，通常必须在首次提交纳税申报表后三年内，或在支付税款后两年内提交。
   
   特殊地，对于结转退税的申请延长了修改所得税申报表的时限。举例来说，外国税收抵免的申请可以向后结转长达 10 年的时间。需要注意的是，此类结转会影响随后年度提交的纳税申报表，并可能需要提交额外的修订后的所得税申报表，因而对多个年度连续产生影响。
   
   《美国税收法规》规定，如果没有遵守规定的时限并及时提交修订后的所得税申报表，通常不予退税。

退税申请必须包括有关退税原因的全面信息，以及足以让国税局了解申请依据的事实细节。根据国税局的规定，通常需要使用指定的国税局表格提交修改后的申报表。

1. 个人申报表（包括独资企业）适用表格为 1040X 。
2. 对于股份有限公司，适用表格为 1120X 。
3. 对于合伙企业，适用表格为1065X。合伙企业的修改申报表可能还需要填写表格 8082 。
4. 对于S型股份有限公司，适用的表格是 1120S （勾选第 1 页的 H (4) 框，表示修改申报表）。

《美国税收法规》（IRC）对各种违规行为实施处罚，包括因疏忽或不遵守法规而造成的严重少缴税款和少报税款。通常情况下，处罚金额相当于少报金额的 20%。

《美国税收法规》（IRC）对提交虚假纳税申报表的行为实施民事和刑事制裁。值得注意的是，如果最初的纳税申报表被发现有欺诈行为，那么提交修订后的所得税申报表（包括合格修订申报表 (QAR)）的纳税人通常不会免于这些处罚。